সংক্রমণের প্রধান কারণ হল রোগজনক ই. কোলাইয়ের কারণে খাবার এবং জল দূষিত হওয়া। যদিও ই. কোলাই অন্ত্রের ভিতরে বন্ধুত্বপূর্ণ একটি ব্যাকটেরিয়া, তবে এটি রোগজনক প্রজাতির হওয়ার কারণে মানুষের দেহে ব্যাপক ক্ষতি সৃষ্টি করতে পারে। এগুলি এমনকি সুস্থ শরীরেও সংক্রমণ তৈরী করতে এবং ছড়িয়ে পড়তে পারে এই সকল উপায়ে: দূষিত জল পান দূষিত খাবার খাওয়া ই. কোলাই দ্বারা দূষিত মাটিতে উৎপন্ন সব্জি খাওয়ার কারণে অস্বাস্থ্যকর খাদ্যাভ্যাস হাসপাতালের দূষিত আবর্জনার প্রবাহে থাকা ই. কোলাই